На самом деле данная точка зрения несколько ошибочна. 

Конструкция климатической установки транспортного средства способна великолепно справляться со своими функциями даже при открытых окнах и с включенной печкой.
 Для подтверждения этого можно привести в пример кабриолеты, которые также оснащены климат - контролем.
Но мы все же не рекомендуем использовать кондиционер при открытых окнах, по следующим причинам:
    При езде на автомобиле с открытыми окнами и включенным кондиционером возрастают нагрузки на генератор, вследствие чего увеличивается расход потребления топлива;
  Открытые окна при включенном кондиционере ведут к нарушению аэродинамики, что в свою очередь создает определенный дискомфорт для водителей и пассажиров.
Поэтому, во избежание возможных проблем мы рекомендуем закрывать окна при включенном кондиционере.

Источник: ВК techincom_lada